体外转录概述
体外转录(In Vitro Transcription,IVT)是合成mRNA的核心技术,利用RNA聚合酶在试管中从DNA模板合成RNA分子。这是目前生产mRNA药物和疫苗的主要方法。
基本原理
IVT反应需要以下关键组分:
- DNA模板:含有目标序列和启动子
- RNA聚合酶:T7、SP6或T3聚合酶
- 核苷酸底物:ATP、GTP、CTP、UTP(或修饰核苷酸)
- 反应缓冲液:提供适当的离子强度和pH
- 镁离子:RNA聚合酶的必需辅因子
反应流程
模板制备
通过PCR或质粒线性化获得含有T7启动子的DNA模板。模板质量直接影响mRNA产量和质量。
转录反应
在优化条件下进行转录反应,通常在37°C反应2-4小时。反应条件影响产量和dsRNA副产物形成。
加帽
转录后或共转录加帽,添加5'端帽子结构。共转录加帽效率更高,是目前主流方法。
加尾
使用Poly(A)聚合酶添加3'端Poly(A)尾,或在模板中编码Poly(A)序列。
纯化
通过LiCl沉淀、层析等方法纯化mRNA,去除模板DNA、游离核苷酸和副产物。
质量控制
mRNA产品质量控制包括:完整性、纯度、加帽率、Poly(A)尾长度、dsRNA含量等。