向导RNA结构

向导RNA由靶向序列和骨架序列组成,决定了CRISPR系统的特异性。

设计原则

靶向序列选择

  • 20个核苷酸的靶向序列
  • 必须位于PAM序列上游
  • 避免脱靶位点

GC含量

理想的GC含量在40-60%之间,过高或过低都会影响编辑效率。

优秀的向导RNA设计是基因编辑成功的关键因素之一。

设计工具

  • CRISPR Design Tool
  • CHOPCHOP
  • Benchling

总结

合理设计向导RNA对于提高基因编辑效率和降低脱靶效应至关重要。